Ποιες είναι οι δύο πιο συνηθισμένες δευτερεύουσες δομές σε μια πρωτεΐνη;
1. alpha helix: Αυτή η δομή μοιάζει με ένα σπειροειδές ελατήριο, με την πολυπεπτιδική αλυσίδα να στρέφεται γύρω από έναν κεντρικό άξονα. Σταθεροποιείται από δεσμούς υδρογόνου μεταξύ του καρβονυλίου οξυγόνου ενός αμινοξέος και του αμιδίου υδρογόνου ενός αμινοξέος τεσσάρων υπολειμμάτων κάτω από την αλυσίδα.
2. φύλλο βήτα: Αυτή η δομή αποτελείται από εκτεταμένες πολυπεπτιδικές αλυσίδες διατεταγμένες δίπλα-δίπλα, σχηματίζοντας ένα πτυχωτό φύλλο. Σταθεροποιείται επίσης από δεσμούς υδρογόνου, αλλά αυτές συμβαίνουν μεταξύ των γειτονικών πολυπεπτιδίων αλυσίδων και όχι της ίδιας αλυσίδας.