Η υπολογιστική μελέτη αποκαλύπτει πώς σταθεροποιεί το Ebola Nucleocapsid

Ο ιός Ebola είναι ένα θανατηφόρο παθογόνο που προκαλεί αιμορραγικό πυρετό σε ανθρώπους και μη ανθρώπινα πρωτεύοντα. Ο ιός αποτελείται από ένα μονόκλωνο γονιδίωμα RNA που ενθυλακώνεται από πρωτεΐνη νουκλεοκψιδίου (NP). Το NP είναι υπεύθυνο για την προστασία του ιικού RNA από την αποικοδόμηση και για τη διευκόλυνση της αντιγραφής και της μεταγραφής του.

Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι το ΝΡ του ιού Ebola είναι μια εξαιρετικά δυναμική πρωτεΐνη που υφίσταται μια σειρά μεταβολών διαμόρφωσης κατά τη διάρκεια του κύκλου ζωής του. Ωστόσο, οι μοριακοί μηχανισμοί στους οποίους βασίζονται αυτές οι αλλαγές διαμόρφωσης δεν είναι πλήρως κατανοητές.

Σε μια πρόσφατη μελέτη, ερευνητές από το Πανεπιστήμιο του Τέξας στο Ώστιν χρησιμοποίησαν υπολογιστικές μεθόδους για να διερευνήσουν τη δομική δυναμική του NP του ιού Ebola. Τα ευρήματά τους αποκαλύπτουν ότι το NP σταθεροποιείται από ένα δίκτυο δεσμών υδρογόνου και γέφυρες αλατιού μεταξύ των διαφορετικών τομέων του. Αυτό το δίκτυο αλληλεπιδράσεων συμβάλλει στη διατήρηση του NP στη λειτουργική του διαμόρφωση και την εμποδίζει να ξεδιπλώνεται.

Οι ερευνητές διαπίστωσαν επίσης ότι το NP είναι ευαίσθητο στην πρωτεολυτική διάσπαση από την φουρίνη πρωτεάσης ξενιστή. Η διάσπαση της φουρίνης του NP ενεργοποιεί μια σειρά μεταβολών διαμόρφωσης στην πρωτεΐνη που οδηγούν στην απελευθέρωση του ιικού RNA από το νουκλεοκψίδιο.

Αυτά τα ευρήματα παρέχουν νέες γνώσεις στους μοριακούς μηχανισμούς που ρυθμίζουν τη δυναμική διαμόρφωσης του NP του ιού Ebola. Αυτές οι πληροφορίες θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για την ανάπτυξη νέων θεραπευτικών στρατηγικών για τη στόχευση του ΝΡ και την πρόληψη της αναπαραγωγής του ιού.

Η μελέτη δημοσιεύθηκε στο περιοδικό "The Journal of Physical Chemistry B".