Γιατί η φαινόλη αναμίξιμο στο Tris Buffe;
Εδώ είναι γιατί:
* πολικότητα: Το Buffer Tris είναι ένα εξαιρετικά πολικό διάλυμα λόγω της παρουσίας της βάσης Tris (Tris (υδροξυμεθυλ) αμινομεθάνης) και των ιόντων ρυθμιστικού διαλύματος. Η φαινόλη, από την άλλη πλευρά, είναι λιγότερο πολική λόγω του αρωματικού δακτυλίου και της ομάδας υδροξυλίου.
* Διαλυτότητα: Όπως διαλύεται. Λόγω της διαφοράς στην πολικότητα, η ρυθμιστική φαινόλη και το buffer Tris δεν είναι συμβατές και τείνουν να διαχωρίζονται σε ξεχωριστά στρώματα.
* δεσμός υδρογόνου: Ενώ τόσο η φαινόλη όσο και το ρυθμιστικό διάλυμα Tris μπορούν να συμμετάσχουν στη δέσμευση υδρογόνου, η αντοχή και ο τύπος της σύνδεσης υδρογόνου διαφέρουν σημαντικά, συμβάλλοντας περαιτέρω στην ισορροπία τους.
Πρακτικές συνέπειες:
Σε πολλές βιολογικές εφαρμογές, η φαινόλη χρησιμοποιείται για εκχύλιση RNA και DNA. Ωστόσο, το buffer Tris χρησιμοποιείται συχνά σε επόμενα βήματα για να καθαρίσει και να χειριστεί αυτά τα μόρια. Για να εξασφαλιστεί ο σωστός διαχωρισμός και να αποφευχθεί η μόλυνση, η φαινόλη συνήθως εξάγεται μακριά από την υδατική φάση ρυθμιστικού Tris.
Σημαντική σημείωση: Η φαινόλη είναι μια εξαιρετικά διαβρωτική και τοξική ένωση. Θα πρέπει να αντιμετωπίζεται με ακραία φροντίδα και κατάλληλες προφυλάξεις ασφαλείας.