Διαφορά μεταξύ Ti και Ri Plasmid

Κύρια διαφορά – Ti vs Ri Plasmid

Agrobacterium Τα είδη είναι παθογόνα φυτών που προκαλούν διάφορες ασθένειες στα ανώτερα φυτά. Τα πλασμίδια Ti (που προκαλούν όγκους) και Ri (που προκαλούν ρίζες) είναι δύο τύποι φυσικών πλασμιδίων που παράγονται από το Agrobacterium είδος. Τα πλασμίδια Ti παράγονται από το Agrobacterium tumefaciens  ενώ τα πλασμίδια Ri παράγονται από το Agrobacterium rhizogenes . Και τα δύο πλασμίδια Ti και Ri αποτελούνται από ένα μέρος του πλασμιδικού DNA γνωστό ως T-DNA που μεταφέρεται στο γονιδίωμα του φυτού με τη βοήθεια γονιδίων λοιμογόνου δράσης (vir). Η κύρια διαφορά μεταξύ του πλασμιδίου Ti και Ri είναι ότι Το πλασμίδιο Ti προκαλεί όγκο/χοληδόχο στεφάνι σε δίκοτες ενώ το πλασμίδιο Ri προκαλεί τριχωτές ρίζες . Λόγω της ικανότητάς τους να μολύνουν φυτά, τόσο τα πλασμίδια Ti όσο και τα Ri χρησιμοποιούνται ευρέως ως φορείς για την παραγωγή διαγονιδιακών φυτών.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται

1. Τι είναι το Ti Plasmid
     – Ορισμός, δομή, διανυσματική παραγωγή
2. Τι είναι το Ri Plasmid
     – Ορισμός, δομή, σχηματισμός διανύσματος
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ Ti και Ri Plasmid
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Ti και Ri Plasmid
    – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι:Agrobacterium Species, Genetic Engineering, Hairy Roots, Ri Plasmid ( pRi), T-DNA, Ti Plasmid ( pTi), Tumor, vir Genes

Τι είναι το Ti Plasmid

Το πλασμίδιο Ti αναφέρεται σε έναν τύπο πλασμιδίου που επιτρέπει το Agrobacterium tumefaciens να μολύνει φυτά, παράγοντας όγκο/όγκο χοληδόχου στέμματος. Έτσι, το πλασμίδιο Ti αποτελείται τόσο από σχηματισμό όγκου όσο και από λοιμογόνο δράση (vir ) γονίδια. Το vir γονίδια είναι υπεύθυνα για τη μεταφορά του T-DNA που περιέχει τα γονίδια που σχηματίζουν όγκο στο γονιδίωμα του φυτού με εκτομή και ενσωμάτωση. Ένα τυπικό πλασμίδιο Ti αποτελείται από τέσσερις περιοχές:περιοχή Α (Τ-DNA υπεύθυνη για το σχηματισμό όγκου), περιοχή Β (υπεύθυνη για αντιγραφή), περιοχή C (υπεύθυνη για σύζευξη) και περιοχή D (υπεύθυνη για λοιμογόνο δύναμη). Τα γονίδια στην περιοχή T-DNA ελέγχουν την παραγωγή των φυτικών αυξητικών ορμονών (αυξίνη και αγροπίνη), προκαλώντας τον πολλαπλασιασμό των μολυσμένων φυτικών κυττάρων. Και τα δύο άκρα της περιοχής Τ-DNA πλαισιώνονται από μια συνοριακή αλληλουχία που περιέχει άμεσες επαναλήψεις αλληλουχιών 24 ζευγών βάσεων. Μόνο το δεξί περίγραμμα είναι απαραίτητο για τη μεταφορά T-DNA. Η δομή του πλασμιδίου Ti φαίνεται στο σχήμα 1.

Εικόνα 1:Ti Plasmid

Στο Agrobacterium -με τη μεσολάβηση του μετασχηματισμού των γονιδίων, ο φορέας έχει σχεδιαστεί με βάση το Ti-Plasmid. Ο φορέας αποτελείται από αλληλουχίες συνόρων Τ-DNA, το vir γονίδια και την τροποποιημένη περιοχή Τ-DNA. Κατά την τροποποίηση της περιοχής Τ-DNA, τα γονίδια που είναι υπεύθυνα για το σχηματισμό του όγκου αφαιρούνται και αντικαθίστανται από τα ξένα γονίδια που πρόκειται να μετασχηματιστούν.

Τι είναι το Ri Plasmid

Το πλασμίδιο Ri αναφέρεται σε έναν τύπο πλασμιδίου που επιτρέπει το Agrobacterium rhizogenes να μολύνει τα κύτταρα του παντελονιού παράγοντας τριχωτές ρίζες. Αποτελείται από δύο θραύσματα T-DNA γνωστά ως Tr-DNA και T1-DNA. Και τα δύο θραύσματα διαχωρίζονται από ένα τμήμα DNA 15 kb. Το Tr-DNA είναι παρόμοιο με την περιοχή T-DNA του πλασμιδίου Ti και περιέχει γονίδια που επάγουν την παραγωγή αυξητικών ορμονών. Η περιοχή T1-DNA αποτελείται από τέσσερα γονίδια:rolA (υπεύθυνος για το σχηματισμό τριχωτών ριζών), rolB (επάγει την έναρξη της ρίζας και τον σχηματισμό κάλων), rolC (προωθεί την ανάπτυξη των ριζών) και rollD (καταστέλλει την ανάπτυξη του τύλου). Ο μετασχηματισμός του T-DNA προκαλείται από το vir γονίδια. Ο σχηματισμός τριχωτών ριζών από το Agrobacterium rhizogenes Το εμφανίζεται στο εικόνα 2.

Εικόνα 2:Τριχωτές ρίζες

Τα πλασμίδια Ti αντικαθίστανται ως επί το πλείστον από πλασμίδια Ri στη γενετική μηχανική.

Ομοιότητες μεταξύ Ti και Ri Plasmid

• Τα πλασμίδια Ti και Ri παράγονται φυσικά από το Agrobacterium.
• Και οι δύο τύποι πλασμιδίων προκαλούν ασθένειες σε πολλά δικοτυλήδονα φυτά.
• Τόσο τα πλασμίδια Ti όσο και τα Ri μεταφέρουν ένα μέρος του DNA του πλασμιδίου που είναι γνωστό ως T DNA στο γονιδίωμα του φυτού με τη βοήθεια γονιδίων λοιμογόνου δράσης (vir).
• Το μέγεθος και των δύο πλασμιδίων Ti και Ri είναι περίπου 200 kb.
• Οι ρυθμιστικές αλληλουχίες ορισμένων γονιδίων που βρίσκονται στο Τ DNA και των δύο πλασμιδίων αναγνωρίζονται από τους κυτταρικούς μηχανισμούς των φυτών.
• Τα άλλα γονίδια στο T DNA αποτελούνται από προκαρυωτικές ρυθμιστικές αλληλουχίες.
• Λόγω της ικανότητας να μολύνουν φυτικά κύτταρα, τόσο τα πλασμίδια Ti όσο και Ri χρησιμοποιούνται στη γενετική μηχανική για την παραγωγή διαγονιδιακών φυτών.

Διαφορά μεταξύ Ti και Ri Plasmid

Ορισμός

Πλασμίδιο Ti: Το πλασμίδιο Ti είναι ένας τύπος πλασμιδίου που επιτρέπει στα βακτήρια να μολύνουν φυτά, παράγοντας όγκο/όγκο χοληδόχου στέμματος.

Ri Plasmid: Το πλασμίδιο Ri είναι ένας τύπος πλασμιδίου που επιτρέπει στα βακτήρια να μολύνουν τα φυτικά κύτταρα παράγοντας τριχωτές ρίζες.

Τύπος Agrobacterium είδος

Πλασμίδιο Ti: Το πλασμίδιο Ti παράγεται από το Agrobacterium tumefaciens.

Ri Plasmid: Το πλασμίδιο Ri παράγεται από το Agrobacterium rhizogenes .

Μέγεθος

Πλασμίδιο Ti: Το μέγεθος του πλασμιδίου Ti είναι 180-205 kb.

Ri Plasmid: Το μέγεθος του πλασμιδίου Ri είναι 250 kb.

Τύπος ασθένειας

Πλασμίδιο Ti: Το πλασμίδιο Ti επάγει το σχηματισμό χοληδόχου στεφάνης/όγκου.

Ri Plasmid: Το πλασμίδιο Ri προκαλεί το σχηματισμό τριχωτών ριζών.

Τύπος μελέτης

Πλασμίδιο Ti: Τα πλασμίδια Ti έχουν μελετηθεί λιγότερο σε σύγκριση με τα πλασμίδια Ri.

Ri Plasmid: Τα πλασμίδια Ri είναι καλά μελετημένα.

Συμπέρασμα

Το πλασμίδιο Ti και το πλασμίδιο Ri είναι δύο τύποι πλασμιδίων που βρίσκονται σε διαφορετικά Agrobacterium είδος. Τόσο τα πλασμίδια Ti όσο και τα πλασμίδια Ri αποτελούνται από T-DNA και vir γονίδια. Τα πλασμίδια Ti μπορούν να βρεθούν στο Agrobacterium tumefaciens που προκαλεί το σχηματισμό όγκου της χοληδόχου στεφάνης. Τα πλασμίδια Ri μπορούν να βρεθούν στο Agrobacterium rhizogenes που προκαλεί το σχηματισμό τριχωτών ριζών. Η κύρια διαφορά μεταξύ του πλασμιδίου Ti και Ri είναι ο τύπος της νόσου που προκαλείται από κάθε τύπο πλασμιδίου.

Αναφορά:

1. "Διάλεξη 26:Ti and Ri Plasmids." NPTEL, IIT Guwahati, Διαθέσιμο εδώ.
2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. «Agrobacterium rhizhogenes και Ri Plasmid». Διαθέσιμο εδώ.

Εικόνα Ευγενική προσφορά:

1. «Πλασμίδιο Ti» Από τον Mouagip – Ίδιο έργο (CC0) μέσω Commons Wikimedia
2. "Agrobacterium rhizogenes" By FruitDefendu – Δική μου εργασία (CC BY-SA 3.0) μέσω Commons Wikimedia