Γιατί απαιτούνται δύο διαφορετικοί εκκινητές για την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης;
* Ειδικότητα: Κάθε εκκινητής έχει σχεδιαστεί για να δεσμεύεται με μια συγκεκριμένη ακολουθία σε αντίθετα σκέλη του μορίου DNA. Αυτό εξασφαλίζει ότι αντιγράφεται μόνο η επιθυμητή περιοχή στόχου.
* κατευθυντικότητα: Οι δύο εκκινητές είναι συμπληρωματικοί προς τα αντίθετα σκέλη του DNA και δεσμεύονται σε αντίθετες κατευθύνσεις. Αυτό είναι ζωτικής σημασίας επειδή η πολυμεράση DNA, το ένζυμο που είναι υπεύθυνο για την αντιγραφή του DNA, μπορεί να επεκτείνει μόνο έναν κλώνο DNA προς μία κατεύθυνση.
* Δημιουργία μιας καθορισμένης περιοχής: Η περιοχή μεταξύ των δύο εκκινητών γίνεται το πρότυπο για σύνθεση DNA. Η πολυμεράση αρχίζει να αντιγράφει από το 3 'άκρο κάθε εκκινητή, κινείται ο ένας προς τον άλλον. Αυτό έχει ως αποτέλεσμα την ενίσχυση του θραύσματος DNA που βρίσκεται μεταξύ των δύο εκκινητών.
Εν ολίγοις: Οι δύο εκκινητές λειτουργούν ως "bookends" για την αλληλουχία DNA -Target, εξασφαλίζοντας ότι μόνο η επιθυμητή περιοχή ενισχύεται. Αυτό καθιστά την PCR μια εξαιρετικά συγκεκριμένη και ευέλικτη τεχνική για τον εντοπισμό και τη μελέτη συγκεκριμένων αλληλουχιών DNA.