Το μοντέλο μοριακής μολύνσεως των εξελικτικών σχέσεων βασίζεται στην υπόθεση ότι οι μεταβολές στις αλληλουχίες μακρομορίων;
Αυτό σημαίνει ότι:
* Οι μεταλλάξεις συσσωρεύονται με σταθερό ρυθμό με την πάροδο του χρόνου.
* Ο αριθμός των διαφορών μεταξύ δύο ακολουθιών είναι ανάλογος του χρόνου, αφού αποκλίνουν από έναν κοινό πρόγονο.
Αυτό επιτρέπει στους επιστήμονες να χρησιμοποιούν το ρυθμό της μοριακής εξέλιξης για να εκτιμήσουν τον χρόνο απόκλισης μεταξύ διαφορετικών ειδών ή γενεαλογών.
Ωστόσο, είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι το μοριακό ρολόι δεν είναι τέλειο. Ο ρυθμός μετάλλαξης μπορεί να ποικίλει ανάλογα με παράγοντες όπως:
* το συγκεκριμένο γονίδιο ή πρωτεΐνη που μελετάται.
* Ο χρόνος γενιάς του οργανισμού.
* Οι επιλεκτικές πιέσεις που δρουν στον οργανισμό.
Επομένως, το μοντέλο μοριακού ρολογιού χρησιμοποιείται συχνά σε συνδυασμό με άλλες μεθόδους για την εκτίμηση των εξελικτικών σχέσεων και των χρόνων απόκλισης.
