Σύμφωνα με τον Lynn Margulis ευκαρυωτικά κύτταρα μπορεί να έχουν εξελιχθεί;
Συγκεκριμένα, πρότεινε την ενδοοσυμβιοτική θεωρία , που δηλώνει ότι:
* μιτοχόνδρια προέρχεται από αερόβια βακτήρια που κατακλύθηκαν από μεγαλύτερα προκαρυωτικά κύτταρα.
* Χλωροπλάστες προέρχεται από φωτοσυνθετικά βακτήρια που κατακλύθηκαν από μεγαλύτερα προκαρυωτικά κύτταρα.
Αυτή η θεωρία υποδηλώνει ότι αυτά τα προ -προκαρυωτικά κύτταρα δεν είχαν αφομοιωθεί από το κύτταρο ξενιστή, αλλά μάλλον έζησαν μέσα τους και τελικά σχημάτισαν μια συμβιωτική σχέση, εξελίσσεται στα οργανίδια που γνωρίζουμε σήμερα.
Η θεωρία του Margulis έχει γίνει ευρέως αποδεκτή και υποστηριζόμενη από τεράστιες αποδείξεις, επανάσταση στην κατανόησή μας για την εξέλιξη των ευκαρυωτικών κυττάρων.