Τι εννοείς με την απαρίθμηση των βακτηρίων;

Η "απαρίθμηση των βακτηρίων" αναφέρεται στην τη διαδικασία καταμέτρησης του αριθμού των βακτηρίων σε ένα δείγμα . Αυτό είναι ένα κρίσιμο βήμα σε πολλούς τομείς, όπως:

* Έρευνα μικροβιολογίας: Μελετώντας την ανάπτυξη των βακτηρίων, την αντίσταση στα αντιβιοτικά και άλλες ιδιότητες.

* Ασφάλεια τροφίμων: Αξιολόγηση της ασφάλειας των τροφίμων και εξασφαλίζοντας ότι είναι απαλλαγμένα από επιβλαβή βακτήρια.

* Περιβαλλοντική παρακολούθηση: Προσδιορισμός του επιπέδου της βακτηριακής μόλυνσης σε νερό, έδαφος ή αέρα.

* Κλινική διάγνωση: Τον εντοπισμό βακτηριακών λοιμώξεων και την παρακολούθηση της θεραπείας τους.

Υπάρχουν αρκετές μέθοδοι για την απαρίθμηση των βακτηρίων, το καθένα με τα δικά του πλεονεκτήματα και περιορισμούς:

1. Άμεση μέτρηση:

* Μικροσκοπικές μετρήσεις: Παρατηρώντας απευθείας βακτήρια κάτω από μικροσκόπιο χρησιμοποιώντας θάλαμο μέτρησης.

* Κυομετρία ροής: Χρησιμοποιώντας μια δέσμη λέιζερ για να μετρήσετε μεμονωμένα βακτήρια καθώς περνούν από ένα στενό κανάλι.

2. Μέθοδοι με βάση την καλλιέργεια:

* Μετράει η πλάκα: Αραίωση του δείγματος και εξάπλωση σε πλάκες άγαρ, στη συνέχεια μετρώντας τον αριθμό των αποικιών που αναπτύσσονται.

* ΜΕΘΟΔΟΣ Πιθανός αριθμός (MPN): Αραίωση του δείγματος και εμβολιασμού πολλαπλών σωλήνων με διαφορετικές αραιώσεις, στη συνέχεια, εκτιμώντας τον αριθμό των βακτηρίων που βασίζονται στο πρότυπο ανάπτυξης.

3. Μοριακές μέθοδοι:

* Ποσοτική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (qPCR): Ανίχνευση και ποσοτικοποίηση ειδικών αλληλουχιών ϋΝΑ που σχετίζονται με βακτήρια στόχου.

* αλληλουχία επόμενης γενιάς (NGS): Αλληλουχία όλο το DNA σε ένα δείγμα για τον προσδιορισμό και τον ποσοτικό προσδιορισμό διαφορετικών βακτηρίων.

Η επιλογή της σωστής μεθόδου εξαρτάται από διάφορους παράγοντες:

* Ο τύπος των βακτηρίων που μελετάται: Ορισμένες μέθοδοι είναι πιο κατάλληλες για συγκεκριμένους βακτηριακούς τύπους.

* Το μέγεθος του δείγματος: Ορισμένες μέθοδοι είναι πιο αποτελεσματικές για μεγάλα δείγματα.

* Το επίπεδο ακρίβειας που απαιτείται: Ορισμένες μέθοδοι είναι ακριβέστερες από άλλες.

* Οι διαθέσιμοι πόροι: Ορισμένες μέθοδοι απαιτούν εξειδικευμένο εξοπλισμό ή εμπειρογνωμοσύνη.

Ανεξάρτητα από την επιλεγμένη μέθοδο, η απαρίθμηση των βακτηρίων παρέχει πολύτιμες πληροφορίες σχετικά με τον αριθμό και τον τύπο των βακτηρίων που μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την ενημέρωση των αποφάσεων σχετικά με την έρευνα, την ασφάλεια ή τη θεραπεία.