Τι αναφέρεται η χαρτογράφηση στη διαδικασία διαφοροποίησης των κυττάρων;
1. Χαρτογράφηση του "τοπίου" διαφοροποίησης των κυττάρων:
* Αυτό αναφέρεται στην κατανόηση των μονοπατιών και των ρυθμιστικών δικτύων που διέπουν τη διαφοροποίηση των κυττάρων. Περιλαμβάνει:
* Προσδιορισμός των βασικών παραγόντων μεταγραφής, των μορίων σηματοδότησης και των επιγενετικών τροποποιήσεων που ελέγχουν την έκφραση γονιδίων σε διαφορετικά στάδια διαφοροποίησης.
* Χαρτογράφηση των αλληλεπιδράσεων μεταξύ αυτών των παραγόντων Για να δημιουργήσετε ένα λεπτομερές μοντέλο του ρυθμιστικού τοπίου.
* Μελετώντας πώς οι εξωτερικοί συνθήκες και οι περιβαλλοντικοί παράγοντες επηρεάζουν αυτές τις οδούς .
2. Χαρτογράφηση κυτταρικής μοίρας:
* Αυτό αναφέρεται στην παρακολούθηση της γραμμής και του αναπτυξιακού δυναμικού των μεμονωμένων κυττάρων κατά τη διαφοροποίηση. Οι τεχνικές που χρησιμοποιούνται για αυτό περιλαμβάνουν:
* Παρακολούθηση γραμμών: Χρησιμοποιώντας γενετικούς δείκτες για να ακολουθήσουν την τύχη των μεμονωμένων κυττάρων και των απογόνων τους.
* αλληλουχία ενός κυττάρου: Ανάλυση των προφίλ έκφρασης γονιδίων των μεμονωμένων κυττάρων για τον προσδιορισμό της κατάστασης διαφοροποίησης και του δυναμικού τους.
Παράδειγμα:
Φανταστείτε έναν ερευνητή που μελετά τη διαφοροποίηση των βλαστικών κυττάρων σε νευρώνες.
* Μπορεί να χαρτογραφήσουν το "τοπίο" με τον εντοπισμό βασικών παραγόντων μεταγραφής που ελέγχουν την νευρωνική ανάπτυξη και διερευνώντας τον τρόπο με τον οποίο αλληλεπιδρούν μεταξύ τους και με εξωτερικά σήματα.
* Μπορεί επίσης να χαρτογραφήσουν τη μοίρα των κυττάρων Χρησιμοποιώντας την ανίχνευση γραμμών για να δείτε πώς τα βλαστοκύτταρα δημιουργούν διαφορετικούς νευρωνικούς υποτύπους.
Συνοπτικά:
Η "χαρτογράφηση" στη διαφοροποίηση των κυττάρων μπορεί να αναφέρεται στην κατανόηση των σύνθετων ρυθμιστικών δικτύων που διέπουν τις αποφάσεις της μοίρας των κυττάρων ή την παρακολούθηση της γραμμής και του αναπτυξιακού δυναμικού των μεμονωμένων κυττάρων. Και οι δύο είναι απαραίτητες για την κατανόηση του τρόπου με τον οποίο τα κύτταρα αποκτούν τις εξειδικευμένες λειτουργίες τους.