Ποιες χημικές αντιδράσεις θα χρειαστούν για τη μετατροπή ενός πολυπεπτιδίου σε μικρές υπομονάδες;
υδρόλυση είναι μια χημική αντίδραση όπου προστίθεται νερό για να σπάσει ένα μεγαλύτερο μόριο σε μικρότερα μόρια. Στην περίπτωση των πολυπεπτιδίων, προστίθεται νερό για να σπάσει τους πεπτιδικούς δεσμούς μεταξύ αμινοξέων.
Δείτε πώς λειτουργεί:
1. Το μόριο νερού (H2O) προσεγγίζει τον πεπτιδικό δεσμό: Το άτομο οξυγόνου στο νερό προσελκύεται από τον άνθρακα καρβονυλίου (C =Ο) του πεπτιδικού δεσμού.
2. ιόν υδρογόνου (Η+) από το νερό συνδέεται με το άτομο αζώτου: Το άτομο υδρογόνου από το νερό συνδέεται με το άτομο αζώτου του πεπτιδικού δεσμού.
3. Ομάδα υδροξυλίου (ΟΗ-) από το νερό συνδέεται με τον άνθρακα καρβονυλίου: Η ομάδα υδροξυλίου από το νερό συνδέεται με τον άνθρακα καρβονυλίου του πεπτιδικού δεσμού.
4. Ο δεσμός μεταξύ των ατόμων άνθρακα και αζώτου σπάει, απελευθερώνοντας τα δύο αμινοξέα.
ένζυμα ονομάζεται πεπτιδάσες ή πρωτεάσες Καταλύει αυτήν την αντίδραση υδρόλυσης, επιταχύνοντας τη διαδικασία. Διαφορετικές πεπτιδάσες στοχεύουν συγκεκριμένους πεπτιδικούς δεσμούς, οδηγώντας στην παραγωγή διαφόρων μικρών υπομονάδων (πεπτίδια ή μεμονωμένα αμινοξέα).
Παράδειγμα:
Μια πολυπεπτιδική αλυσίδα με την αλληλουχία Gly-Ala-Val-Leu θα μπορούσε να υδρολυθεί σε:
* gly-ala + val-leu (Με τη διάσπαση του πεπτιδικού δεσμού μεταξύ ALA και VAL)
* gly + ala-val-leu (Με τη διάσπαση του πεπτιδίου δεσμού μεταξύ Gly και ALA)
* gly-ala-val + leu (Με τη διάσπαση του πεπτιδίου δεσμού μεταξύ Val και Leu)
Τελικά, μέσω επαναλαμβανόμενων αντιδράσεων υδρόλυσης, ένα πολυπεπτίδιο μπορεί να διασπαστεί στα μεμονωμένα δομικά του αμινοξέα.
