Ποια είναι η διαφορά μεταξύ Transposon και Retrotransposon

Η κύρια διαφορά μεταξύ transposon και retrotransposon είναι ότι τα τρανσποζόνια ή τα «γονίδια άλματος» ή τα μετατιθέμενα στοιχεία (TE) είναι οι αλληλουχίες DNA που μετακινούνται από τη μια θέση στην άλλη στο γονιδίωμα, ενώ το ρετροτρανσποζόνιο ή η κατηγορία 1 ΤΕ είναι ένας τύπος τρανσποζονίου που απαιτεί αντίστροφη μεταγραφή:τη μεταγραφή του RNA σε DNA .

Το τρανσποζόνιο και το ρετροτρανσποζόνιο είναι δύο τύποι αλληλουχιών DNA που αλλάζουν τη θέση τους μέσα στο γονιδίωμα.

Βασικοί όροι

Retrotransposon, Transposable Elements, Transposon

Τι είναι το Transposon

Τρανσποζόνιο ή μετατιθέμενα στοιχεία (TE) AKA "Jumping genes" είναι τύποι αλληλουχιών DNA που κινούνται μέσα στο γονιδίωμα ενός συγκεκριμένου οργανισμού:ευκαρυωτικού ή προκαρυωτικού. Η γενετιστής Barbara McClintock του Cold Spring Harbor Laboratory στη Νέα Υόρκη αναγνώρισε τα μεταφερόμενα στοιχεία πριν από περισσότερα από 50 χρόνια. Αυτά τα μεταφερόμενα στοιχεία εμφανίζονται γενικά σε μεγάλους αριθμούς στο γονιδίωμα. περίπου το 50% του ανθρώπινου γονιδιώματος αποτελείται από τρανσποζόνια. Το πιο σημαντικό, η μεταφορά έχει ως αποτέλεσμα μια μετάλλαξη στο σημείο προσγείωσης, που καθορίζει τη λειτουργία του μεταφερόμενου στοιχείου. Ως εκ τούτου, μερικά από αυτά τα γονίδια άλματος μπορούν να προκαλέσουν ανάπτυξη ασθένειας στον οργανισμό. Από την άλλη πλευρά, τα TE μπορούν να περιέχουν siRNA για τη μεσολάβηση της σίγασής τους. Τα τρανσποζόνια μπορούν επίσης να προωθήσουν την εξέλιξη με μετατόπιση.

Εικόνα 1:Τρανσποζόνιο DNA

Ωστόσο, τα transposons μπορεί να είναι είτε αυτόνομα είτε μη αυτόνομα. Τα αυτόνομα τρανσποζόνια κινούνται μόνα τους, αλλά τα μη αυτόνομα τρανσποζόνια απαιτούν την παρουσία άλλου τρανσποζονίου για τη μεταφορά τους. Επιπλέον, τα μη αυτόνομα τρανσποζόνια δεν περιέχουν γονίδια για τρανσποτάση και ανάστροφη μεταγραφάση. Η κύρια μέθοδος ταξινόμησης των τρανσποζονίων είναι η απαίτησή τους για αντίστροφη μεταγραφή για τη μεταφορά. Τα ΤΕ τάξης Ι είναι ρετροτρανσποζόνια που υφίστανται αντίστροφη μεταγραφή ενώ τα ΤΕ τάξης 2 είναι τρανσποζόνια DNA που δεν υφίστανται αντίστροφη μεταγραφή κατά τη μεταφορά. Συνήθως, τα τρανσποζόνια DNA είναι αυτόνομα και κωδικοποιούν την τρανσποτάση.

Τι είναι το Retrotransposon

Το στοιχείο ρετρομεταθέτησης ή κατηγορίας 1 είναι ένας τύπος μετατιθέμενου στοιχείου που απαιτεί αντίστροφη μεταγραφή για τη μεταφορά. Ωστόσο, τα ρετροτρανσποζόνια κινούνται μέσω της δράσης των ενδιάμεσων RNA. Πριν εισαχθούν στη θέση στόχου, υποβάλλονται σε αντίστροφη μεταγραφή πίσω στο DNA. Επίσης δεν κωδικοποιούν για τρανσποζάση. Επιπλέον, τα LTR TE και τα non-LTR TE είναι οι δύο τύποι ρετροτρανσποζονίων. Γενικά, το κύριο χαρακτηριστικό γνώρισμα των LTR TE είναι η παρουσία μακρών τερματικών επαναλήψεων (LTR) και στα δύο άκρα.

Εικόνα 2:Ρετροτρανσποζόνη

 Επιπλέον, Alu και L1 είναι δύο παραδείγματα ΤΕ που δεν είναι LTR. Συνήθως, έως και 15-17% του ανθρώπινου γονιδιώματος αποτελείται από ΤΕ που δεν είναι LTR.

Ομοιότητες μεταξύ Transposon και Retrotransposon

• Το τρανσποζόνιο και το ρετροτρανσποζόνιο είναι δύο τύποι αλληλουχιών DNA που κινούνται εντός του γονιδιώματος.
• Η λειτουργία τους εξαρτάται από τον ιστότοπο-στόχο τους.
• Αποτελούν ένα μεγάλο μέρος του ανθρώπινου γονιδιώματος.

Διαφορά μεταξύ Transposon και Retrotransposon

Ορισμός

Το τρανσποζόνιο αναφέρεται σε μια αλληλουχία DNA που μπορεί να αλλάξει τη θέση της μέσα σε ένα γονιδίωμα, μερικές φορές δημιουργώντας ή αναστρέφοντας μεταλλάξεις και αλλάζοντας τη γενετική ταυτότητα και το μέγεθος του γονιδιώματος του κυττάρου, ενώ το ρετροτρανσποζόνιο αναφέρεται σε έναν τύπο γενετικό συστατικό που αντιγράφει και επικολλάται σε διαφορετικές γονιδιωματικές τοποθεσίες (τρανσποζόνιο) μετατρέποντας το RNA ξανά σε DNA μέσω της διαδικασίας αντίστροφης μεταγραφής χρησιμοποιώντας ένα ενδιάμεσο μεταφοράς RNA.

Γνωστό και ως

Τα τρανσποζόνια είναι επίσης γνωστά ως "γονίδια άλματος" ή μεταθέσιμα στοιχεία (TEs) ενώ τα ρετροτρανσποζόνια είναι γνωστά ως στοιχεία κατηγορίας 1.

Αντίστροφη μεταγραφή

Το τρανσποζόνιο DNA δεν υφίσταται αντίστροφη μεταγραφή ενώ το ρετροτρανσποζόνιο υφίσταται αντίστροφη μεταγραφή.

Ταξινόμηση

Τα τρανσποζόνια DNA και τα ρετροτρανσποζόνια είναι οι δύο τύποι τρανσποζονίων, ενώ τα LTR-TE και τα μη LTR-TE είναι οι δύο τύποι ρετροτρανσποζονίων.

Συμπέρασμα

Συνοπτικά, το τρανσποζόνιο και το ρετροτρανσποζόνιο είναι δύο τύποι αλληλουχιών DNA που κινούνται μέσω του γονιδιώματος προς στόχευση θέσεων, ξεκινώντας τις λειτουργίες τους. Επιπλέον, τα τρανσποζόνια αποτελούν ένα μεγάλο μέρος του ανθρώπινου γονιδιώματος. Το DNA transposon και το retrotransposon είναι δύο τύποι τρανσποζονίων. Τα ρετροτρανσποζόνια κινούνται με αντίστροφη μεταγραφή. Επομένως, η κύρια διαφορά μεταξύ τρανσποζονίου και ρετροτρανσποζονίου είναι η μετάθεση με αντίστροφη μεταγραφή.