Συναρμολόγηση του μεταγραφικού στοιχείου ενός επιβλαβή ζιζάνιο:νέοι πόροι για τη μελέτη του τρόπου εισβολής των φυτών
Περίληψη:
* Τα χωροκατακτητικά φυτά* είναι μη ιθαγενή είδη που εξαπλώνονται ταχέως και αρνητικά επηρεάζουν τα οικοσυστήματα, τη γεωργία και την ανθρώπινη υγεία. Η κατανόηση των μοριακών μηχανισμών που αποτελούν τη βάση της επιτυχίας τους είναι ζωτικής σημασίας για την ανάπτυξη αποτελεσματικών στρατηγικών διαχείρισης. * Η Ambrosia artemisiifolia* (κοινή ragweed) είναι ένα επιβλαβές ζιζάνιο που προέρχεται από τη Βόρεια Αμερική που έχει εισβάλει σε πολλά μέρη του κόσμου, προκαλώντας σημαντικές οικονομικές και υγειονομικές επιβαρύνσεις. Εδώ, αναφέρουμε τη συναρμολόγηση *de novo *του *a. Artemisiifolia* Transcriptome χρησιμοποιώντας την αλληλουχία μικρού ανάγνωσης Illumina. Η συναρμολόγησή μας έδωσε ένα μεταγραφικό υψηλής ποιότητας με πάνω από 100.000 μεταγραφές και βαθμολογία πληρότητας BUSCO 97,1%. Συνταξιάσαμε το μεταγραφικό στοιχείο χρησιμοποιώντας διάφορες βάσεις δεδομένων και εντοπίσαμε υποθετικούς ορθόλογους για γονίδια που εμπλέκονται σε βασικές βιολογικές διεργασίες, συμπεριλαμβανομένης της φωτοσύνθεσης, της ανταπόκρισης του στρες και της αναπαραγωγής. Τα μεταγραφικά δεδομένα μας παρέχουν έναν πολύτιμο πόρο για περαιτέρω μελέτες σχετικά με τη μοριακή οικολογία, την εξέλιξη και τη διαχείριση του *α. Artemisiifolia* και άλλα χωροκατακτητικά φυτά.
Λέξεις -κλειδιά: *Ambrosia artemisiifolia*, συναρμολόγηση μεταγραφικής, γονιδιακή έκφραση, χωροκατακτητικά φυτά, μοριακή οικολογία
