Ποια είναι μια από τις κύριες ιδέα πίσω από τους οργανισμούς φυλογενετικής ταξινόμησης;
* Κοινή καταγωγή: Οι οργανισμοί ταξινομούνται με βάση το πόσο πρόσφατα μοιράστηκαν έναν κοινό πρόγονο. Οι στενά συνδεδεμένοι οργανισμοί μοιράζονται έναν πιο πρόσφατο κοινό πρόγονο από τους μακρινούς σχετικούς οργανισμούς.
* κοινόχρηστα χαρακτηριστικά: Οι οργανισμοί ομαδοποιούνται με βάση τα κοινά χαρακτηριστικά που είναι μοναδικά για τη γενεαλογία τους και κληρονομούνται από τον κοινό πρόγονο τους. Αυτά τα χαρακτηριστικά ονομάζονται "προερχόμενα χαρακτηριστικά" ή "Synapomorphies".
* Εξελικτική ιστορία: Η φυλογενετική ταξινόμηση στοχεύει να αντικατοπτρίζει την εξελικτική ιστορία της ζωής στη γη. Αυτό σημαίνει να κατανοήσουμε πώς οι διάφορες ομάδες οργανισμών έχουν εξελιχθεί από έναν κοινό πρόγονο και πώς οι σχέσεις τους έχουν αλλάξει με την πάροδο του χρόνου.
Στην ουσία, η φυλογενετική ταξινόμηση αφορά την κατανόηση του «δέντρου της ζωής» και τη χρήση εξελικτικών σχέσεων με τους ομαδικούς οργανισμούς με ουσιαστικό τρόπο.