Ποια είναι η διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα στη δομή της πρωτεΐνης

Η κύρια διαφορά μεταξύ του μοτίβου και του τομέα στη δομή της πρωτεΐνης είναι ότι ένα μοτίβο είναι εξαιρετικά δευτερεύον Δομή ενώ ένας τομέας πρωτεΐνης είναι μια τριτοταγής δομή πρωτεϊνών. Επιπλέον, τα μοτίβα εκτελούν παρόμοιες βιολογικές λειτουργίες μέσω μιας συγκεκριμένης οικογένειας πρωτεϊνών, ενώ ο τομέας πρωτεΐνης εξελίσσεται, λειτουργεί και υπάρχει ανεξάρτητα από την υπόλοιπη πρωτεϊνική αλυσίδα.

Το μοτίβο και ο τομέας είναι τύποι δομικών στοιχείων που μπορούν να εμφανιστούν σε μια πρωτεϊνική αλυσίδα. Επιπλέον, έχουν δομική και λειτουργική σημασία στις πρωτεΐνες.

Βασικές περιοχές που καλύπτονται 

1. Τι είναι το μοτίβο στη δομή της πρωτεΐνης
     – Ορισμός, Δομή, Σημασία
2. Τι είναι ένας τομέας στη δομή πρωτεΐνης
     – Ορισμός, Δομή, Σημασία
3. Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ μοτίβου και τομέα στη δομή πρωτεΐνης
     – Περίληψη κοινών χαρακτηριστικών
4. Ποια είναι η διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα στη δομή πρωτεΐνης
     – Σύγκριση βασικών διαφορών

Βασικοί όροι 

Τομέας πρωτεΐνης, μοτίβο πρωτεΐνης, δομή πρωτεΐνης, υπερδευτεροβάθμια δομή, τριτογενής δομή

Τι είναι το Motif in Protein Structure 

Ένα μοτίβο είναι μια σούπερ δευτερεύουσα δομή μιας πρωτεΐνης. Γενικά, η πρώτη εξελισσόμενη τρισδιάστατη δομή μιας πρωτεΐνης είναι η δευτερεύουσα δομή, η οποία μπορεί να είναι είτε άλφα-έλικα είτε βήτα φύλλο. Επίσης, αυτή η δευτερεύουσα δομή σχηματίζεται για να εξουδετερώσει τη φυσική πολικότητα διαφορετικών αμινοξέων στη δομή της πρωτογενούς πρωτεΐνης, η οποία είναι μια αλληλουχία αμινοξέων. Τυπικά, αυτή η εξουδετέρωση συμβαίνει μέσω του σχηματισμού δεσμών υδρογόνου. Επιπλέον, αυτές οι δευτερεύουσες δομές συνδυάζονται μεταξύ τους για να σχηματίσουν αυτά τα μοτίβα. Ο συνδυασμός γίνεται μέσω μικρών βρόχων.

Εικόνα 1:Μοτίβο ινών ψευδαργύρου

Επιπλέον, μερικές φορές, μοτίβα μιας συγκεκριμένης οικογένειας πρωτεϊνών εκτελούν παρόμοια λειτουργία. Για παράδειγμα, το μοτίβο ινών ψευδαργύρου εκτελεί μια λειτουργία σύνδεσης DNA. Μερικά άλλα παραδείγματα μοτίβων στη δομή της πρωτεΐνης είναι το μοτίβο βήτα-φουρκέτας, το μοτίβο του ελληνικού κλειδιού, το μοτίβο βρόχου Omega, το μοτίβο έλικας-βρόχου-έλικας, το μοτίβο έλικας-στροφή-έλικα, το μοτίβο φωλιάς, το μοτίβο κόγχης κ.λπ. 

Τι είναι ένας τομέας στη δομή πρωτεΐνης 

Ένας τομέας στη δομή πρωτεΐνης είναι η τριτοταγής δομή μιας πρωτεΐνης. Επιπλέον, σχηματίζεται, υπάρχει και λειτουργεί ανεξάρτητα από τα άλλα συστατικά της πρωτεΐνης. Αν και ένα μοτίβο σχηματίζεται μέσω της αλληλεπίδρασης δευτερευόντων δομικών στοιχείων σε μια πρωτεΐνη, οι αλληλεπιδράσεις που εμφανίζονται μεταξύ δευτερογενών δομικών στοιχείων είναι ισχυρότερες σε έναν τομέα. Εδώ, διάφορα είδη δεσμών μπορούν να σχηματιστούν μεταξύ αυτών των δευτερευόντων δομικών στοιχείων. Από αυτό, ο κύριος τύπος δεσμών που σχηματίζονται είναι οι δισουλφιδικές γέφυρες. Είναι επίσης οι πιο σταθερές αλληλεπιδράσεις.

Εικόνα 2:Τρεις τομείς πυροσταφυλικής κινάσης

Επιπλέον, ιονικοί δεσμοί ή γέφυρες άλατος μπορούν επίσης να σχηματιστούν μεταξύ των θετικά και αρνητικά φορτισμένων αμινοξέων στις δευτερεύουσες δομές. Επιπλέον, μπορούν να σχηματιστούν δεσμοί υδρογόνου για να σταθεροποιήσουν την τριτοταγή δομή. Από την άλλη πλευρά, οι πρωτεϊνικοί τομείς έχουν τυπικά μια σφαιρική δομή και είναι διαλυτή στο νερό. Επίσης, ένας τομέας πρωτεΐνης εκτελεί μια μοναδική λειτουργία μιας πρωτεΐνης. Γενικά, μπορούν να αναγνωριστούν τέσσερις κατηγορίες πρωτεϊνικών περιοχών. τομείς all-α, all-β τομείς, α+β τομείς και α/β τομείς.

Ομοιότητες μεταξύ Motif and Domain in Protein Structure 

• Το μοτίβο και ο τομέας είναι δύο συστατικά ενός δομή πρωτεΐνης.
• Έχουν τόσο δομική όσο και λειτουργική σημασία σε τη δομή της πρωτεΐνης.
• Επίσης, και τα δύο αποτελούνται από αλυσίδα αμινοξέων που συνδέονται με πεπτιδικούς δεσμούς.
• Επιπλέον, δημιουργούνται μέσω του αλληλεπιδράσεις άλφα-ελίκων και φύλλων βήτα.
• Εξάλλου, και οι δύο είναι τρισδιάστατες δομές.

Διαφορά μεταξύ Motif and Domain in Protein Structure 

Ορισμός 

Ένα μοτίβο στη δομή πρωτεΐνης αναφέρεται σε μια αλυσιδωτή βιολογική δομή που αποτελείται από συνδεσιμότητα μεταξύ δευτερογενών δομικών στοιχείων, ενώ ένας τομέας στη δομή πρωτεΐνης αναφέρεται σε μια ανεξάρτητη μονάδα αναδίπλωσης των τριών διαστατική δομή πρωτεΐνης. Επομένως, αυτή είναι η κύρια διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα.

Τύπος δομής 

Μια άλλη διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα είναι ότι ένα μοτίβο είναι μια υπερδευτερογενής δομή μιας πρωτεΐνης, ενώ ένας τομέας είναι μια τριτοταγής δομή της πρωτεΐνης.

Σχηματισμός 

Επιπλέον, ένα μοτίβο σχηματίζεται από τις συνδεδεμένες άλφα-έλικες και βήτα φύλλα μέσω βρόχων, ενώ ένας τομέας σχηματίζεται από το σχηματισμό δισουλφιδικών γεφυρών, ιοντικών δεσμών και δεσμών υδρογόνου μεταξύ πλευρικών αλυσίδων αμινοξέων.

Σημασία 

Τα μοτίβα έχουν κυρίως μια δομική λειτουργία στη δομή της πρωτεΐνης, ενώ οι τομείς έχουν κυρίως λειτουργική σημασία.

Συνάρτηση 

Επιπλέον, τα μοτίβα έχουν παρόμοιες λειτουργίες μέσω πρωτεϊνικών οικογενειών, ενώ οι τομείς έχουν μοναδικές λειτουργίες.

Σταθερότητα 

Επιπλέον, τα μοτίβα δεν είναι σταθερά ανεξάρτητα, ενώ οι τομείς είναι ανεξάρτητα σταθεροί. Ως εκ τούτου, αυτή είναι επίσης μια σημαντική διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα.

Συμπέρασμα 

Ένα μοτίβο στη δομή πρωτεΐνης είναι μια υπερδευτερεύουσα δομή μιας πρωτεΐνης. Η συνδεσιμότητα μεταξύ άλφα-έλικων και φύλλων βήτα παράγει μοτίβα. Επίσης, έχουν παρόμοιες λειτουργίες σε μια συγκεκριμένη οικογένεια πρωτεϊνών. Από την άλλη πλευρά, ένας τομέας είναι η τριτοταγής δομή μιας πρωτεΐνης. Είναι σημαντικό ότι μπορεί να σχηματιστεί και να υπάρχει ανεξάρτητα στη δομή της πρωτεΐνης. Επίσης, έχει μια μοναδική λειτουργία στη δομή της πρωτεΐνης. Επομένως, η κύρια διαφορά μεταξύ μοτίβου και τομέα είναι η δομή και η σημασία.