Ένας σκελετός άνθρακα είναι ομοιοπολικά συνδεδεμένος τόσο σε μια αμινομάδα όσο και σε μια καρβοξυλική ομάδα. Όταν τοποθετείται στο νερό;
Όταν τοποθετείται σε νερό, ένα αμινοξύ θα:
* Ionize: Η καρβοξυλική ομάδα θα χάσει ένα πρωτόνιο (Η+), καθιστώντας αρνητικά φορτισμένο (COO-), ενώ η ομάδα αμινοί θα κερδίσει ένα πρωτόνιο και θα γίνει θετικά φορτισμένο (NH3+). Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι η καρβοξυλική ομάδα είναι όξινη και η αμινομάδα είναι βασική.
* συμπεριφέρονται ως zwitterion: Ένα zwitterion είναι ένα μόριο που έχει τόσο θετικό όσο και αρνητικό φορτίο. Λόγω των διπλών φορτίων του, το αμινοξύ θα είναι σε θέση να αλληλεπιδράσει τόσο με πολικά όσο και με μη πολικά μόρια στο νερό.
* σχηματίζουν δεσμούς υδρογόνου: Οι φορτισμένες ομάδες στο αμινοξύ θα μπορούν να σχηματίσουν δεσμούς υδρογόνου με τα μόρια του νερού, καθιστώντας το διαλυτό.
Συνολικά, ένα αμινοξέο τοποθετημένο σε νερό θα λειτουργήσει ως zwitterion , είναι διαλυτό και είναι σε θέση να αλληλεπιδράσει τόσο με πολικά όσο και με μη πολικό περιβάλλον.