Οι οργανικές ενώσεις δεν θα σχηματίζονται στη συσκευή Miller-Urey εάν υπάρχει O2 γιατί αυτό όχι;
* Το οξυγόνο είναι ένα ισχυρό οξειδωτικό: Αντιδράς εύκολα και σπάει πολλά από τα οργανικά μόρια που σχηματίζονται στο πείραμα Miller-Urey. Αυτή η διαδικασία ονομάζεται οξείδωση.
* Η ατμόσφαιρα της πρώιμης γης πιθανότατα μειώθηκε: Το πείραμα Miller-Urey προσομοίωσε την ατμόσφαιρα της πρώιμης γης, η οποία πιστεύεται ότι ήταν σε μεγάλο βαθμό απαλλαγμένη από ελεύθερο οξυγόνο. Αντ 'αυτού, ήταν πλούσιο σε μείωση των αερίων όπως το μεθάνιο (CH4), η αμμωνία (NH3) και το υδρογόνο (H2). Αυτά τα αναγωγικά αέρια είναι απαραίτητα για τη σύνθεση οργανικών μορίων από ανόργανες πρόδρομους.
* Οξυγόνο καταστρέφει τα δομικά στοιχεία: Το οξυγόνο θα αντιδρούσε με τα απλά οργανικά μόρια όπως το μεθάνιο και η αμμωνία, εμποδίζοντας τους να δημιουργήσουν και να αντιδράσουν περαιτέρω για να δημιουργήσουν πιο σύνθετα μόρια όπως τα αμινοξέα, τα σάκχαρα και τα νουκλεοτίδια.
Στην ουσία, η παρουσία οξυγόνου θα "ουσιαστικά" καίει "τις οργανικές ενώσεις όπως σχηματίζονται, εμποδίζοντας τους να συσσωρεύουν και να δημιουργούν τα δομικά στοιχεία της ζωής.
Η επιτυχία του πειράματος Miller-Urey στη δημιουργία οργανικών μορίων υπογραμμίζει τη σημασία μιας μειωμένης ατμόσφαιρας στα αρχικά στάδια της εμφάνισης της ζωής. Η μεταγενέστερη εμφάνιση του οξυγόνου μέσω της φωτοσύνθεσης άλλαξε δραματικά τη χημεία της Γης και άνοιξε ένα νέο μονοπάτι για την εξέλιξη της ζωής.