Ποιοι είναι οι τρεις τύποι χημικών αλληλεπιδράσεων που βρίσκονται στις πρωτεΐνες;
1. Δέσμευση υδρογόνου: Αυτός είναι ο πιο συνηθισμένος τύπος αλληλεπίδρασης στις πρωτεΐνες. Εμφανίζεται μεταξύ ενός ατόμου υδρογόνου που συνδέεται ομοιοπολικά με ένα εξαιρετικά ηλεκτροαρνητικό άτομο (όπως το οξυγόνο ή το άζωτο) και ένα άλλο ηλεκτροαρνητικό άτομο. Αυτοί οι δεσμοί είναι σχετικά αδύναμοι αλλά άφθονες, συμβάλλοντας σημαντικά στη δομή και τη σταθερότητα της πρωτεΐνης.
2. Ιονικές αλληλεπιδράσεις: Αυτά συμβαίνουν μεταξύ των αντίθετα φορτισμένων πλευρικών αλυσίδων αμινοξέων. Για παράδειγμα, η θετικά φορτισμένη πλευρική αλυσίδα λυσίνης μπορεί να αλληλεπιδράσει με την αρνητική φορτισμένη πλευρική αλυσίδα γλουταμινικού. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις είναι ισχυρότερες από τους δεσμούς υδρογόνου αλλά ασθενέστερες από τους ομοιοπολικούς δεσμούς.
3. υδρόφοβες αλληλεπιδράσεις: Αυτά δεν είναι τεχνικά δεσμοί αλλά μάλλον δυνάμεις που οδηγούν τις μη πολικές πλευρικές αλυσίδες αμινοξέων για να συσσωρεύονται μαζί, αποφεύγοντας την επαφή με το νερό. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις διαδραματίζουν κρίσιμο ρόλο στην αναδίπλωση πρωτεϊνών και στον σχηματισμό πεδίων πρωτεϊνών.
Αυτές οι αλληλεπιδράσεις, μαζί με δισουλφιδικές γέφυρες (ομοιοπολικοί δεσμοί), συνεργάζονται για να δημιουργήσουν τη μοναδική τρισδιάστατη δομή κάθε πρωτεΐνης, καθορίζοντας τη λειτουργία της.