Ποιες είναι μερικές ερωτήσεις που έχουν ακόμη οι επιστήμονες σχετικά με την ενδοσυμία;
Η προέλευση των ενδοσυματικών συμβάντων:
* Πώς εμφανίστηκαν η αρχική κατάπληξη των προκαρυωτικών προγόνων των μιτοχονδρίων και των χλωροπλαστών; Ήταν ένα τυχαίο γεγονός, μια ελεγχόμενη διαδικασία ή ένας συνδυασμός και των δύο;
* Ποιες επιλεκτικές πιέσεις οδήγησαν την εξέλιξη αυτών των ενδοσυμπιοτικών σχέσεων; Ποιες συνθήκες καθιστούσαν επωφελές για το κελί ξενιστή να διατηρήσει ζωντανή αυτά τα προκαρυωτικά;
* Πώς εμφανίστηκε η μεταφορά γενετικού υλικού από το endosymbiont στον πυρήνα του ξενιστή; Αυτή η διαδικασία, γνωστή ως γονιδιακή μεταφορά, δεν είναι ακόμα πλήρως κατανοητή.
Η εξέλιξη των οργανιδίων:
* Ποιοι είναι οι ειδικοί μηχανισμοί της μεταφοράς γονιδίων και η επακόλουθη ενσωμάτωση των γονιδίων στο γονιδίωμα του ξενιστή; Πώς ρυθμίστηκαν αυτά τα γονίδια και εκφράστηκαν στο νέο κυτταρικό πλαίσιο;
* Πώς εξελίχθηκαν η δομή και η λειτουργία των μιτοχονδρίων και των χλωροπλάστες από τους προκαρυωτικούς προγόνους τους; Πώς προσαρμόστηκαν στο νέο τους περιβάλλον και αναπτύσσουν εξειδικευμένους ρόλους μέσα στο κελί ξενιστή;
* Ποια είναι η πλήρης εξελικτική ιστορία αυτών των οργανιδίων; Υπήρχαν πολλοί γύρους ενδοσύγκίωσης ή ήταν αυτά τα μόνα σημαντικά γεγονότα;
Ο σημερινός ρόλος των οργανιδίων:
* Πώς αλληλεπιδρούν τα μιτοχόνδρια και οι χλωροπλάστες με τον πυρήνα του κυττάρου του ξενιστή και άλλα οργανίδια; Ποιες διαδρομές σηματοδότησης υπάρχουν μεταξύ τους και πώς ρυθμίζουν ο ένας τον άλλον;
* Ποιο είναι το πλήρες φάσμα των λειτουργιών των μιτοχονδρίων και των χλωροπλάστες; Πέρα από την παραγωγή ενέργειας, πιθανόν να διαδραματίζουν κρίσιμους ρόλους σε κυτταρικές διεργασίες όπως η σηματοδότηση, η ανταπόκριση στο στρες και ακόμη και η γήρανση.
Το μέλλον της ενδοσύμης:
* Μπορούμε να αναδημιουργήσουμε τη διαδικασία της ενδοσύμης στο εργαστήριο; Αυτό θα μπορούσε να έχει συνέπειες για την κατανόηση της εξέλιξης των οργανιδίων και ενδεχομένως ακόμη και για τη συνθετική βιολογία.
* Μπορούμε να σχεδιάσουμε νέες ενδοσυματικές σχέσεις με διαφορετικούς προκαρυώτες; Αυτό θα μπορούσε να οδηγήσει σε νέες κυτταρικές λειτουργίες και ακόμη και στη δημιουργία νέων τύπων οργανισμών.
Αυτά τα ερωτήματα υπογραμμίζουν τη συνεχιζόμενη φύση της έρευνας στον τομέα αυτό και τις πολλές συναρπαστικές ανακαλύψεις που πρέπει να γίνουν ακόμα.