Μια σειρά υδρόφοβων πλευρικών αλυσίδων θα συγκεντρωθεί μαζί ως πτυχές πρωτεΐνης σε ένα υδατικό διάλυμα και θα σταθεροποιηθεί από;
Εδώ είναι μια κατανομή:
* υδρόφοβη επίδραση: Τα μόρια του νερού είναι πολικά και σχηματίζουν ισχυρούς δεσμούς υδρογόνου μεταξύ τους. Τα μη πολωτικά μόρια (όπως οι υδρόφοβες πλευρικές αλυσίδες) διαταράσσουν αυτούς τους δεσμούς υδρογόνου και επομένως είναι δυσμενείς σε ένα υδατικό περιβάλλον. Για να ελαχιστοποιηθεί αυτή η διαταραχή, οι υδρόφοβες πλευρικές αλυσίδες συσσωρεύονται μαζί στο εσωτερικό της πρωτεΐνης, μακριά από το νερό.
* σταθεροποίηση: Αυτή η ομαδοποίηση δεν οδηγείται από άμεση έλξη μεταξύ υδρόφοβων πλευρικών αλυσίδων. Αντ 'αυτού, είναι συνέπεια της αυξημένης εντροπίας (διαταραχής) των γύρω μορίων του νερού όταν οι υδρόφοβες ομάδες θάβονται μέσα στην πρωτεΐνη. Αυτή η αύξηση στην εντροπία οδηγεί τη διαδικασία αναδίπλωσης και σταθεροποιεί τη διπλωμένη δομή πρωτεΐνης.
Συνοπτικά, οι υδρόφοβες πλευρικές αλυσίδες σε μια πρωτεΐνη οδηγούνται να συναντηθούν σε ένα υδατικό περιβάλλον για να ελαχιστοποιήσουν τη διάσπαση των μορίων του νερού και να αυξήσουν τη συνολική εντροπία του συστήματος. Αυτή είναι μια σημαντική κινητήρια δύναμη στην αναδίπλωση πρωτεϊνών.